Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc1O35379 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms