Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ColqO35348 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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ColqO35348 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ColqO35348 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ColqO35348 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ColqO35348 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ColqO35348 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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