Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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