Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr1aO35134 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1aO35134 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms