Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms