Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Casq1O09165 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms