Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trove2O08848 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms