Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms