Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MttpO08601 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MttpO08601 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MttpO08601 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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MttpO08601 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MttpO08601 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms