Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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