Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms