Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms