Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5294J3QP53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms