Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm10428J3QNV7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10428J3QNV7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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