Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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