Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm20873J3QMQ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm20873J3QMQ9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Gm20873J3QMQ9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Gm20873J3QMQ9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Gm20873J3QMQ9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20873J3QMQ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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