Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms