Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm17535J3KMR8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm17535J3KMR8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm17535J3KMR8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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