Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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