Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20828J3KMI7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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