Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4bG5E8Z2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms