Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms