Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfgef1G3X9K3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms