Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim55G3X8Y1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms