Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Srp72F8VQC1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Srp72F8VQC1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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