Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3371F7CQW8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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