Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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