Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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