Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm10378F6XQQ1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10378F6XQQ1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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