Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf6F6VAN0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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