Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1bF6V0H0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms