Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm20671F6TVX7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20671F6TVX7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm20671F6TVX7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm20671F6TVX7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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