Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms