Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rdh16f1E9Q9P8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rdh16f1E9Q9P8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms