Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms