Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms