Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms