Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC005561E9Q5E2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms