Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
ApobE9Q414 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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