Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Zfp558E9Q1J0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zfp558E9Q1J0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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