Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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