Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfta2E9PXB6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms