Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsf1E9PWW9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsf1E9PWW9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms