Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim30bE9PVL6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms