Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc175E9PVB3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc175E9PVB3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc175E9PVB3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc175E9PVB3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc175E9PVB3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc175E9PVB3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc175E9PVB3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms