Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms