Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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