Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Clip3B9EHT4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Clip3B9EHT4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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