Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pnldc1B2RXZ1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pnldc1B2RXZ1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms