Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cyp26c1B2RXA7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms